Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r212Q8R268 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r212Q8R268 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms