Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ltbp4Q8K4G1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ltbp4Q8K4G1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms