Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms