Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Polr1eQ8K202 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms