Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmbrd1Q8K0B2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms