Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Afg3l2Q8JZQ2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Afg3l2Q8JZQ2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms