Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwnkQ8CIW5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwnkQ8CIW5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms