Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc73Q8CDM4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms