Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd2Q8C561 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd2Q8C561 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms