Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Nhlrc2Q8BZW8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc2Q8BZW8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc2Q8BZW8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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