Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Catsper4Q8BVN3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Catsper4Q8BVN3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms