Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cep55Q8BT07 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cep55Q8BT07 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms