Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
D130040H23RikQ8BII3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
D130040H23RikQ8BII3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms