Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Htatsf1Q8BGC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htatsf1Q8BGC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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