Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh3b1Q80VQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b1Q80VQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms