Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Actr5Q80US4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Actr5Q80US4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms