Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arhgef17Q80U35 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arhgef17Q80U35 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms