Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trim17Q7TPM3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms