Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim12Q78RX3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim12Q78RX3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms