Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd3eapQ76KJ5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd3eapQ76KJ5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms