Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Chsy1Q6ZQ11 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms