Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cxcl3Q6W5C0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cxcl3Q6W5C0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cxcl3Q6W5C0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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