Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc154Q6RUT8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc154Q6RUT8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms