Protein–RNA interactions for Protein: Q6R5C6

Gm10277, Predicted gene 10277, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10277Q6R5C6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm10277Q6R5C6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10277Q6R5C6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Gm10277Q6R5C6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm10277Q6R5C6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm10277Q6R5C6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm10277Q6R5C6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10277Q6R5C6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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