Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc46a1Q6PEM8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms