Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg16l2Q6KAU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms