Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ParpbpQ6IRT3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ParpbpQ6IRT3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms