Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Usp7Q6A4J8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp7Q6A4J8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp7Q6A4J8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Usp7Q6A4J8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp7Q6A4J8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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