Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kiaa1549Q68FD9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kiaa1549Q68FD9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms