Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou4f3Q63955 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms