Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms