Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV7

Setd5, SET domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd5Q5XJV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Setd5Q5XJV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Setd5Q5XJV7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Setd5Q5XJV7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms