Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scaf1Q5U4C3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms