Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdcp1Q5U462 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms