Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sco1Q5SUC9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sco1Q5SUC9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Sco1Q5SUC9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sco1Q5SUC9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms