Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trdv4Q5R1A3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trdv4Q5R1A3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms