Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtp3Q5QGU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtp3Q5QGU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms