Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RilpQ5ND29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms