Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Taf3Q5HZG4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf3Q5HZG4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf3Q5HZG4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms