Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp22Q5DU02 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp22Q5DU02 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms