Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc84Q4VA36 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms