Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0U0

1700057G04Rik, Phospholipid scramblase, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700057G04RikQ3V0U0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700057G04RikQ3V0U0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms