Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chpf2Q3UU43 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms