Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc190Q3URK1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms