Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cog7Q3UM29 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cog7Q3UM29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms