Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2-M3Q31093 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-M3Q31093 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms