Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lingo4Q149C3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lingo4Q149C3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms