Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cpne7Q0VE82 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cpne7Q0VE82 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms