Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itgb8Q0VBD0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb8Q0VBD0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms