Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps8Q0P5W1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps8Q0P5W1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps8Q0P5W1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms